لم يتوصل العلم بعد لفهم مفصّل عن أسباب الصداع المتكرر، بحيث إن الأسباب تعزى إلى الأوعية الدموية الموجودة في العنق والرأس، بالإضافة إلى الأعصاب المتمركزة في الدماغ والأنسجةِ المحيطة به، ويطرح البحث الطبي المكثف قائمة من المسببات وهي، وفقاً لما ذكره موقع سطور:
حدوث الشد في عضلات العنق، مما يحدث ضغطًا وتوترًا على مناطق الرأس، ويسبب الشعور بالألم.
تحفيز العصب ثلاثي التوائم، وهو عصب موجود في الوجه، ويسبب تحفيزه ألمًا خلف العينين واحمرارًا فيهما، بالإضافة لانسداد الأنف.
التغيرات الهرمونية، كمثل تغير نسب هرموني السيروتونين والإستروجين داخل الجسم، فعندما تصبح نسب هذه الهرمونات غير منتظمة، قد يدفع ذلك لحدوث صداع متكرر.
الوراثة.
الالتهابات أو المشاكل الحاصلة في الأوعية الدموية حول الدماغ، كمثل السكتات الدماغية، وتعد أحد أسباب الصداع المتكرر التي تستدعي التدخل الطبي الفوري.
التعرض لعدوى تسبب التهابًا في منطقة الرأس، كمثل التهاب السحايا.
الإصابة السابقة أو الحالية بالأورام الدماغية.
إصابة الدماغ الرضّية.